검사 3일 전부터 씨 있는 과일, 검정쌀 등 소화되지 않는 잡곡, 2일 전부터는 단단한 섬유질의 채소와 고추가루가 든 음식은 피해야 합니다. 검사를 오전에 하는 경우 전날 낮에는 미음으로 가벼운 식사를 하고 검사가 끝날 때까지 물을 제외하고 아무것도 먹지 않습니다.
검사를 오후에 하는 경우 전날 저녁 6시, 소량의 가벼운 유동식을 하고 물 이외의 것은 먹지 않습니다. 단, 검사 3시간 전까지만 생수를 마실 수 있습니다.

검사를 오전에 하는 경우 검사 전날 밤 6시에 약 1시간에 걸쳐 관장약을 복약합니다. 검사를 오후에 하는 경우 검사 당일 새벽 6시부터 약 1시간에 걸쳐 관장약을 복약합니다. 관장약을 다 복약해도 배변이 되지 않을 경우 걷거나 움직이도록 하고 복부를 가볍게 마사지 하는 것도 도움이 되며 심한 변비가 있을 경우 검사 2~3일 전 변비약 등으로 미리 배변을 원활히 하는 것이 도움이 될 수 있습니다.

복약 중인 약물에서 중단이 필요한 약제와 지속해야 하는 약제를 확인해야 합니다. 특히 혈액 응고를 늦추는 약제를 복용하는 경우 의사와 상의하는 것이 좋습니다.
평소에 복용하던 심장약, 혈압약, 천식약 등은 그대로 복용할지 여부를 의사와 상의하는 것이 좋습니다. 특히 조직검사 시에 아스피린 계열은 출혈을 잘 멈추지 않게 하므로 주의가 필요합니다.